Çocuklarda patolojik ağız kokusunun en sık nedeni geniz eti büyümesi ve sinüzitdir. Gece uyurken horlayan çocukda, geceleri sık öksüren çocukda, gündüzleri boğazında gıdıklanma, takılma hissi olan çocukda, sık boğaz enfeksiyonu geçiren çocukda geniz eti büyümesi olabilir; Banyodan sonra saçlarını kurutmuyan, sık başı ağrıyan, sık boğazını temizleyen, sık öksürüğü olan bir çocukda ağız kokusu varsa en olası hastalık sinüzitdir. Sık kulağı ağrıyan, kulaktan akıntısı olan bir çocukta ağız kokusunun nedeni dış kulak yolu efkeksiyonuda olabilir. Diş çürükleri, diş eti enfeksiyonu olan çocukda kötü ağız kokusu vardır. Sık diş eti iltihabı geçiren, ağzı kokan, bacaklarda ağrısı olan bir çocukda ağız kokusunun nedeni kan kanseride olabilir. Geceleri ağzından salya gelen, geceleri dişlerini çok gıcırdatan, makat bölgesini kaşıyan, pişiği ve ağız kokusu olan çocukda kıl kurdu olabilir; Ağız kokusu olan bir çocuk sık burnunu kaşıyorsa alerjik rinit olabilir; Ağız kokusu olan bir çocuk sık gözlerini kaşıyorsa alerjik konjonktivit olabilir;
B12, çinko, D vitamini eksikliği ile ilişkili ağızda yara, PFAP(farenjit, ateş, beze büyümesi ve ağızda yara) ile ilişkili ağızda yara, Behçet hastalığı ile ilişkili ağızda ülserleri olan çocukda kötü ağız kokusu olabilir. Ağız kokusu olan bir çocukda sık karın ve göğüs ağrısı, yemek yedikten sonra yemek borusunda yanma hissi oluyorsa, yemek yedikten sonra boğazına acı su geliyorsa reflü hastalığı olabilir. Sık karnı ağrıyan ve ağzı kokan bir çocukda, midede yanma, acıma hissi varsa mide ülseri olabilir. Katı gıdaları rahat yutan, ancak sıvı gıdaları yutma güçlüğü ve kötü ağız kokusu olan bir çocukda, yemek borunun alt kısmının genişlediği akalazya hastalığı olabilir. Ağız kokusu olan genç bir kızda; saçlarını yutma öyküsü varsa trikobezoar denilen midede kitle olabilir. Ağız kokusu olan bir çocukda çiğ yenmeyen sebze yeme(örneğin patates yeme öyküsü varsa) öyküsü varsa fitobezoar denilen midede kitle olabilir. Şeker hastalığı olan çocukların ağzında aseton kokusu, böbrek yetmezliği olan çocukların ağzında balık kokusu olur. Karaciğer yetmezliğine neden olan metabolik hastalıkarda(üre siklus defekti, tirozinemi gibi) ağızda küf kokusu, bozulmuş kan kokusu vardır. Kızıl, kızamık, dizanteri, akciğer tüberkülozu, zatürre pis ağız kokusuna neden olur. 5 gündür düşmeyen ateşi olan, dudakları kırmızı ve ağzı pis kokan çocukda kawasaki hastalığı olabilir. Ayak eklemleri şişen, ateşi çıkan bir çocuğun ağzı kokuyorsa kalbi yalayan hastalık olan akut romatizmal ateş olabilir. Gözleri ve ağzı kuruyan bir çocukda, kötü ağız kokusunun en sık nedeni Sjögren sendromudur. Ağzı kokan bir çocukda baş dönmesi, baş ağrısı, tek taraflı gözde görme bulanıklığı ve ellerde uyuşma varsa Multiple Skleroz hastalığı olabilir.